Simultáneamente, a través del Decreto 336/2025, también rubricado por el jefe de Gabinete Guillermo Francos, se dispuso la creación del Comando General Electoral, que será el encargado de garantizar la seguridad en los comicios. Este cuerpo transitorio, conformado por fuerzas armadas y de seguridad nacionales y provinciales, tendrá a su cargo la custodia de los locales de votación, el resguardo del material electoral, la vigilancia de las sedes de procesamiento de datos y el traslado de las urnas.
El operativo comenzará a desplegarse 55 días antes del comicio, en línea con la aprobación judicial de la Boleta Única de Papel, conforme a la Acordada 26/2025 de la Cámara Nacional Electoral. Participarán efectivos del Ejército, la Armada, la Fuerza Aérea, Gendarmería, Prefectura, Policía Federal, Policía de Seguridad Aeroportuaria y fuerzas provinciales. Todos estarán bajo la conducción de un Comandante General Electoral, designado por el Ministerio de Defensa, con presencia activa desde las 8:00 de la mañana del día anterior a la elección hasta la finalización del escrutinio y repliegue del material.
